تضم كلية الزراعة (15) قسماً علمياً كالآتي:
- البساتين.
- إنتاج الدواجن و الأسماك.
- الإنتاج الحيواني.
- الوراثة.
- المحاصيل.
- مبيدات الآفات.
- الهندسة الزراعية والنظم الحيوية.
- النبات الزراعي.
- الكيمياء الحيوية الزراعية.
- الحشرات الإقتصادية والحيوان الزراعي.
- علوم وتكنولوجيا الألبان.
- علوم الأراضي.
- الاقتصاد الزراعي و إدارة الأعمال الزراعية.
- علوم وتكنولوجيا الأغذية.
- الإرشاد الزراعي والمجتمع الريفي.
تمنح الكلية درجة البكالوريوس في :
1- العلوم الزراعية ( بنظام الساعات المعتمدة) في أحد البرامج الآتية:
- الإنتاج النباتي
- الإنتاج الحيواني و الداجني
- وقاية النبات
- العلوم الاقتصادية والاجتماعية الزراعية
- التصنيع الغذائي و الألبان
- الأراضي و المياة
- التكنولوجيا
- الحيوية الزراعية
- إدارة الأعمال الزراعية
2- الهندسة الزراعية (بنظام الساعات المعتمدة).
تمنح دبلوم الدراسات العليا في التخصصات الآتية:
- البرامج الإرشادية.
- التخطيط الريفي.
- التنمية الريفية.
- تربية وانتاج الحيوانات الزراعية.
- تربية وإنتاج الدواجن.
- استصلاح الاراضي.
- تكنولوجيا الأغذية.
- كيمياء التحاليل الزراعية.
- إنتاج التقاوي.
- الميكروبيولوجيا الزراعية التطبيقية.
- النحل والحرير.
- أمراض النبات ومكافحتها في الأراضي الجديدة.
- الهندسة الوراثية.
- مراقبة جودة الأغذية وحماية المستهلك.
- إنتاج الأسماك.
- التسويق والتجارة الخارجية للمنتجات الزراعية.
- مشاتل البساتين.
- تنمية الإنتاج الحيواني في البيئه الصحراوية.
- جودة الإنتاج الداجني.
- الزراعات المحمية.
- آفات البيئة الصحراوية.
- الآفات الزراعية.
- مراقبة جودة اللبن ومنتجاته.
- كيمياء ثلوث البيئة.
- زراعة الأراضي الصحراوية.
- مكافحة آفات الصوب والمحميات.
- القوي والآلات الزراعية.
- فسيولوجيا نمو النبات تحت الظروف الصحراوية.
- تحسين وصيانة الأراضي.
- نظم وتكنولوجيا الري الحديث.
- مبيدات الآفات الزراعية.
تمنح درجة الماجستير والدكتوراه في التخصصات الآتية:
- الإرشاد الزراعي.
- المجتمع الريفي.
- الاقتصاد الزراعي.
- الإنتاج الحيواني.
- إنتاج الدواجن.
- إنتاج الاسماك.
- الفاكهة.
- الخضر.
- نباتات الزينة.
- الحشرات الاقتصادية.
- الحيوان الزراعي.
- أراضي.
- الصناعات الغذائية.
- الألبان.
- الكيمياء الحيوية الزراعية.
- مبيدات الآفات.
- المحاصيل الحقلية.
- النبات الزراعي.
- أمراض النبات.
- الميكروبيبولوجيا الزراعية.
- الهندسة الزراعية.
- الوراثة.
يُذكر أن كلية الزراعة في جامعة المنوفية تعود نشأتها إلى أكتوبر عام 1942م تحت اسم المعهد العالي الزراعي ثم تحول المعهد إلى كلية عام 1969م.